关于白血病中51融合基因筛查检测项目开展通知
2018-05-31 阅读数：10408
尊敬的客户：
您好！非常感谢您对广州华银医学检验中心的支持和帮助！
由于白血病中51融合基因筛查开展，故自2018年06月01日起送检的上述标本的新项目开展，具体说明如下：
一、项目名称
白血病中51融合基因筛查
二、临床意义
用于筛查白血病患者48（+3）种融合基因类型
三、临床背景
大部分白血病存在某种染色体改变，产生新的编码融合蛋白的融合基因，迄今报道白血病涉及至少50多种典型的类型特异的染色体易位，涉及大量基因融合。如在>95%的CML患者中存在BCR-ABL(t(9;22)(q34;q11))融合基因；95%的APL患者携带PML-RARα（t(15;17)(q22;q12)）融合基因，这类融合基因通常被认为是与其相关的白血病的重要诊断标志，可通过检测该类融合基因来辅助诊断白血病，确定具有不同发病机制的白血病群，探索发病原因。世界卫生组织（WHO）2008再版白血病分类方案中，要求对患者在形态学、免疫表型、遗传特性和分子特征综合考虑，其中融合易位是最重要的遗传/分子诊断依据之一。在预后评估中，不同的融合基因反映同中疾病中不同预后分层，如据中华医学会儿童急淋指南，儿童ALL高发重排包括ETV6-RUNX1、E2A-PBX1、MLL重排、BCR-ABL1，前两种重排总体临床危险度为低危或中危，后两者往往归为高危；在微小残留监测中，筛选出的阳性标记物随治疗进展进行监测，如据欧洲白血病指南，CBFB-MYH11、 RUNX1-RUNX1T1、BCR-ABL1等融合基因的RQ-PCR检测可用于AML疗效监测。
以下为厂商提供的48种融合基因的意义（另外3中是融合基因下的细分亚型）：
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序号 |
融合基因 |
染色体易位 |
融合基因说明 |
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1 |
MLL-AF9 |
t(9;11)(p22;q23) |
主要发生在 AML 中。该融合基因往往提示较差的预后。 |
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2＃ |
PML-RARα |
t(15;17)(q24;q21) |
在 APL 中的发生率为 95%。该融合基因可作为诊断和辅助分型 M3 的特异标记，该融合基因提示患者对全反式维甲酸和三氧化二砷治疗有效，且有比较好的预后。 |
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3 |
AML1-ETO |
t(8;21)( q22; q22) |
约 20-40%的 AML-M2 患者有 AML1-ETO，其中 90%的 M2b 亚型含有 AML1-ETO 融合基因并且年龄越小发生率越高。含有 AML1-ETO 的 AML 患者对大剂量阿糖胞苷治疗效果好，具有较高的缓解率，无病生存期长，预后较其他 AML 亚型（M3 除外）好。 |
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4 |
MLL-AF4 |
t(4;11)(q21;q23) |
婴儿 ALL 中发生率为 50-70%，儿童发生率为 2%，成人中发生率为 3-6%。含有 MLL-AF4 的患者发病年龄较低（通常小于 2 岁），病情凶险，预后差。患者对标准治疗方案可能无效，需要强化治疗。目前应用高剂量 Ara-c 治疗，可提高患者预后。 |
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5 |
TEL-AML1 |
t(12;21)(p13;q22) |
在儿童 ALL 中发生率为 25%，目前尚未在 T-ALL,AML 或 NHL 中发现，在成人白血病患者中发生频率一般低于 2%，一般发病年龄小（2-10 岁），WBC 计数低（<50000/L）。此类患者的免疫表型为前 B-ALL，对治疗反应佳，完全缓解时间长，预后好，可用于区分低危险度和高危险度的 ALL 患者，有助于确定合适的治疗方案。 |
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6 |
E2A-PBX1 |
t(1;19)(q23;p13) |
存在于约 3-5%的儿童 ALL 和 3%的成人 ALL。是预后不良的因素，但文献报道不是所有的 E2A-PBX1阳性患者都对治疗反应不良。E2A-PBX1 表达阳性的儿童 ALL 病例初诊时白细胞计数较高，使用强化疗方案后，EFSs 现已接近 80%。 |
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7 |
FIP1L1-PDGFRA |
del(4)(q12) |
见于约 10-15%的特发性嗜酸粒细胞增多患者（HES、CEL 等）。该融合基因提示对格列卫有较好的反应。 |
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8 |
MLL-ENL |
t(11;19)(q23;p13.3) |
可见于 ALL，AML-M4，M5，M1，M2，患者多为小于 1 岁的婴儿。该融合基因预后尚无明确说明，与年龄，免疫表型相关。 |
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9＃ |
BCR-ABL1 |
t(9;22)(q34;q11) |
存在于大约 95%的 CML 病人和 20%的 ALL 病人。BCR/ABL b2a2 和 b3a2 型已经成为 CML 的主要诊断标准，并可指导格列卫的使用，评估预后效果和病情复发情况。e1a2 型融合基因主要见于约 3～5% 的儿童 ALL 和 1/3 的成人 ALL，是 ALL 患者预后较差的因素，该类患者 5 年存活率<20%，因此这类患者需要在缓解后进行骨髓移植治疗。 |
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10 |
SIL-TAL1 |
del(1)(p32) |
发生在 26%的儿童 T-ALL 和 16%的成人。该融合基因可用于辅助 T-ALL 的诊断，疗效监测和 MRD。 |
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11 |
MLL-AF10 |
t(10;11)(p12;q23) |
是 AML-M5 型的特异性标志，多见于儿童，80%的患者小于 3 岁。该融合基因往往提示较差的预后。 |
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12 |
CBFβ-MYH11 |
inv(16)(p13;q22) |
主要见于 30-100% 的 M4Eo 和 10%的不伴异常嗜酸细胞 M4，少见于 M2，是预后较好的因素。该融合基因可作为诊断及分型 M4Eo 的特异标记，其融合基因转录水平可以用来评价 M4Eo 患者 MRD 情况，预见复发。 |
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13 |
AML1-MDS1/EV11 |
t(3;21)(q26; q22) |
MDS1和EVI1基因均位于3q26且位置相邻，可形成 MDS1-EVI1复合体（MECOM基因），进而形成RUNX1-MDS1-EVI1融合基因。AML1/MDS1 融合基因首先发现于CML-BC的患者，在CML-CP、少数治疗相关AML、原发AML或MDS以及MDS后AML中也可见到。该融合基因提示预后不良，生存率低。 |
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14 |
MLL-AFX1 |
t(x;11)( q13; q23) |
研究发现可以增强造血干细胞的自我更新并组织它们成熟。预后差。 |
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15 |
SET-CAN |
del(9)(q34) |
存在于AUL（Acute UndifferentiatedLeukemia），AML和ALL中。目前预后意义不明确。 |
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16 |
E2A-HLF |
t(17;19)(q22;p13) |
发生在少数的ALL中。该融合基因提示预后差，对密集化疗无反应，生存期短。 |
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17 |
DEK-CAN |
t(6;9)(p23;q34) |
在AML中占2%，主要为M2 型，其次为 M4 型，多发于年轻患者（20-30 岁），预后不良。该融合基因可以用于AML的诊断，疗效观察及预后判断。 |
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18 |
MLL-SEPT6 |
t(X;11)(q24;q23) |
发现于婴儿AML中。目前，预后意义尚不明确。 |
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19 |
TLS-ERG |
t(16;21)(p11;q22) |
存在于AML、ALL、CML急变病人中，在非白血病（尤因氏肉瘤）中也存在。该融合基因阳性的急性白血病患者常病情严重，是提示预后不好的因素。 |
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20 |
TEL-PDGFRB |
t(5;12)(q33;p13) |
多见于CML及MDS患者。此融合基因阳性的患者常对格列卫治疗有效。 |
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21 |
MLL-ELL |
t(11;19)(q23;p13.1) |
为AML特异性异常，多发于成人。该融合基因提示预后不良，两年无病生存率为50%。 |
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22 |
MLL-AF17 |
t(11;17)(q23; q21) |
发现于AML中。预后意义尚不明确。 |
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23 |
NPM-RARA |
t(5;17)(q35;q21) |
多发生于APL，含有该融合基因的患者往往维甲酸治疗无效，而采用传统的急性髓性白血病化疗方案治疗可能会有效。 |
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24 |
NPM-MLF1 |
t(3;5)(q25;q34) |
多发生于AML，含有该融合基因的患者往往预后较差，虽然其有较高的治疗缓解率，但是容易发生早期复发，并且中位生存时间往往小于1年，这类患者采用骨髓移植治疗会好于化疗。 |
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25 |
PLZF-RARA |
t(11;17)(q23;q21) |
多发生在APL，含有该融合基因的患者往往维甲酸治疗无效，而采用传统的急性髓性白血病化疗方案治疗可能会有效。 |
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26 |
MLL-AF1q |
t(1;11)(q21;q23) |
见于ANLL和ALL。AML 中高表达者治疗效果较差，诱导缓解后复发率和死亡率高。 |
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27 |
MLL-AF1P |
t(1;11)(p32;q23) |
在ALL，AML 和 MDS 中均有发生。预后与性别和分型相关。 |
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28 |
TEL-ABL1 |
t(9;12) (q34;p13) |
可见于急性或慢性白血病、髓性细胞系或淋巴细胞系白血病。大部分病例伴随嗜酸细胞增多，预后较差。 |
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29 |
AML1-MTG16 |
t(16;21)(q24;q22) |
非常罕见，主要发生在治疗相关的AML或MDS中。携带该融合基因的患者对化疗敏感，治疗反应性好，但是化疗毒性反应较强，需要采用较为缓和的化疗方案。 |
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30 |
AML1-EAP |
t(3;21)( q26; q22) |
主要发生在CML，MDS以及治疗相关白血病，在AML中极少发生。可作为MDS向AML转化过程的标志物。 |
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31 |
MLL-AF6 |
t(6;11)(q27;q23) |
主要发生在 AML 中。该融合基因预后非常差，几乎无缓解，生存期短。 |
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32 |
NUP98-HOXA9 |
t(7;11)( p15; p15) |
多表现为 AML，也可见不伴有 t(9;22)的类 CML 表现或伴 t(9;22)原始细胞危象的 CML |
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33 |
NUP98-HOXA11 |
t(7;11)( p15; p15) |
见于费城染色体阴性的 CML 和少年髓单核细胞性白血病。 |
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34 |
NUP98-HOXA13 |
t(7;11)( p15; p15) |
见于初发 AML。 |
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35 |
NUP98-HOXC11 |
t(11;12)(p15;q13) |
仅在初发 AML 中有病例报道。 |
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36 |
NUP98-HOXD13 |
t(2;11)(q31;p15) |
目前仅在初发 AML 中有病例报道。 |
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37 |
NUP98-PMX1 |
t(1;11)(q23;p15) |
多见于 M2 型 ANLL 中。 |
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38 |
ETV6-PDGFRA |
t(4;12)(q12;p13) |
提示对格列卫治疗反应良好。 |
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39 |
FIPIL1- RARα |
t(4;17)(q12;q21) |
发生于幼年型粒-单核细胞白血病。 |
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40 |
STAT5B- RARα |
der(17)(q21) |
发生于 APL。 |
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41 |
NUMA- RARα |
t(11;17)(q13;q21) |
发生于非典型的 M3 型 ANLL。 |
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42 |
PRKAR1A- RARα |
der(17)(q21;q24) |
发生于 APL。 |
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43 |
TEL-JAK2 |
t(9;12)( p24; p13) |
在 MDS 中发生率 36%，高危型 MDS 中发生率 63%，低危型 MDS 中发生率 25%，该基因有助于了解病情的严重程度。 |
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44＊ |
CALM-AF10 |
t(10;11)(p13;q21) |
发病年龄低，预后不良。 |
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45＊ |
EVI1 |
- |
阳性 AML 患者和儿童ALL患者提示预后较差。同时是CML患者发生急性变的标志物。 |
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46＊ |
HOX11 |
- |
HOX11 定位在 10q24 上，容易被 t(10;14)(q24;q11)或者 t(7;10)(q35;q24)易位激活，发生于 4-7%的 T-ALL 中。HOX11 高表达的儿童 T-ALL 预后比阴性有优势。 |
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47＊ |
HOX11L2 |
- |
影响 AML 患者的预后。 |
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48＊ |
dup MLL |
(11q23) |
预后差。临床缓解率低。 |
备注：
＃标注为亚型细分项目 BCR-ABL1细分210、190、230 共3种，PML-RARA 细分L、S、V共3种
*标注为原43或30不覆盖的新基因
三、技术说明
本检测从血液中提取RNA并逆转录，通过实时荧光定量PCR检测目标融合基因。
1. 本方法是针对融合基因常见的已知的融合形式进行设计，不排除罕见的融合位点存在，不排除假阴性的可能；
2. 本方法的灵敏度为融合基因100 copy、dup MLL和HOX11 1000 copy，该灵敏度适用于初诊患者骨髓或外周血标本送检。
五、临床用途
本项目在30和43个融合基因的基础上，有以下2个方面变化：
1.增加EVI1、HOX11、HOX11L2、dup MLL 和CALM-AF10 5个基因检测，5个基因在AML和ALL中有一定的预后意义;
2.将常见的BCR-ABL和PML-RARA进行亚型分型，以完善筛查项目在初诊阶段与后期监测阶段项目的对接;
建议不满足于现有融合基因筛查，对于整合项目有需求的患者检测；
注：对于明确诊断患者还是建议选择针对性强的融合基因筛查项目，对于儿童ALL患者，还是建议筛查阴性后加Ph样ALL相关基因筛查。
四、采样要求、收费标准及报告时间
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项目代码 |
项目名称 |
检测方法 |
标本类型及注意事项 |
收费（元） |
报告周期 |
开展时间 |
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LIR |
新系统 |
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GC161 |
81259 |
白血病中51融合基因筛查 |
荧光定量PCR法 |
1、 EDTA抗凝骨髓/1-3ml或EDTA抗凝外周血/3-5ml; 2、保存稳定性：室温24小时、冷藏72小时，禁止冷冻 |
2760 |
5-7天 |
2018年2月12日 |
感谢您给予的大力配合！
如有疑问或其它要求请拨打客服免费咨询电话：400-888-1223，我们将竭诚为您服务！
广州华银医学检验中心
二〇一八年五月三十一日
